O Wikipedia: Wedi'i gosod yn yr oes fodern, mae'r stori'n ymwneud â Miharu Rokujou, a oedd eisiau byw bywyd normal yn unig ac etifeddu bwyty Okonomiyaki. Ar hyn o bryd, ei broblem fwyaf oedd y pestering cyson gan Kouichi Aizawa a Durandal Thobari Kumohira, a ddechreuodd Glwb Nindō (忍 道?, Lit. “Way of the Ninja”). Nid oedd Miharu eisiau gwneud dim â “ninjas” ac yn eu gwrthod bob tro. Ond yn fuan, mae grŵp gwirioneddol o ninjas yn ymosod arno ac yn cael ei amddiffyn gan Kouichi a Kumohira. Yno, mae Miharu yn dysgu am y byd ninja cudd Nabari, rolau ei gyd-ddisgybl a'i athro yn y byd hwnnw, ac am y gelf gyfrinachol Shinra Banshou (森羅 万象 Shinrabanshō ?, Goleuo “popeth ym myd natur”) ynddo. Mae'r gelf gyfrinachol, sy'n cynnwys holl wybodaeth y byd, yn chwennych yn Nabari. Ac oherwydd hynny, ni all Miharu ddychwelyd i'w fywyd arferol. Rhaid iddo ddod yn “Rheolwr Nabari” i oroesi. O Baka-Updates: Roedd Rokujou Miharu yn fyfyriwr uchel iau ymddangosiadol gyndyn a oedd yn byw yn ei fyd ei hun. Fodd bynnag, oddi mewn iddo, roedd yn llechu pŵer eithaf Nabari, “Omnipotent”. I feddu ar arf mor oruchaf, tyngodd y Wolf Pack o Iga i ddod â Miharu yn ôl i bentref Iga. Ar y llaw arall, athro Saesneg Miharu, Kumohira sensei, a'i gyd-ddisgybl, Kouichi, oedd y Banten ninjas a'u cenhadaeth oedd amddiffyn Miharu. Felly cychwynnodd rhyfel dros berchnogaeth “Omnipotent”. Er mwyn goroesi, rhaid i Miharu fynd i mewn i'r byd cudd Nabari, i ddod yn frenin.
